临床实践操作是COVID-19患者呼吸道动物细胞群组成及其与宿主相互作用的基础

海洋生物体α生态与ICU中风时间段、SARS-CoV-2病原体负重和钙卫细胞层面方面

首先，基于Shannon生态加权（SDI，方知法则，附请注意1），我们对所挖掘的101个抽样在旧属层面上的α生态完成了归纳。基于归纳我们推测，相同抽样时刻抽样的SDI发挥持久突出差别（Kruskal-Wallis挑选出，p= 0.009），病患住进ICU时以及住进后挖掘的拭子彼此之间的SDI发挥持久突出差别，这确实查看性疾病的发生以及完成外科手术都会对化学物质生态产生状况（由此可知如，整个ICU中风在此之后都会对病患给予青霉素外科手术）。随后，我们对所导致的差别完成了必要性归纳，并推测SDI与抽样时在ICU的中风时间段呈圆形负方面，具肝细胞容而言，病患在ICU行程段越长其生态越低（ρ = -0.53，p = 1.9 * 10-8）。

基于习惯上本站性混合数学模型框架，我们必要性评论者了其他医学或性疾病方面请注意达式与上呼吸种系统化学物质群集生态的方面性：我们基于自动数学模型并不只能搜索算法，对包含多达8种相同暗示请注意达式的所有或许数学模型完成了详尽挑选出（方知法则）。用做重归SDI的请注意达式还包括病患ID（作为随机效可不数据分析）；性疾病方面请注意达式，如ICU时间段、SARS-CoV-2病原体负重或换用机械设计充填；以及据信状况化学物质群集的其他请注意达式，由此可知如给予青霉素（特别是美罗培南/哌拉西林-他唑巴坦以及头孢曲松）或上皮细胞标志物层面（钙卫细胞、C反可不细胞）。在所有后续归纳当中，由于青霉素美罗培南和哌拉西林/他唑巴坦是在相同的医学读物下完成给药性，因此将这些青霉素的换用作为一般而言请注意达式完成分三组。这些数学模型当中展示造出值得一提的是的数学模型（AICc = 121.79；p = 4.06 * 10-8）还包括作为随机效可不数据分析的病患，并推测ICU 行程段与上呼吸种系统化学物质生态彼此之间呈圆形负方面人关系。此外，该数学模型推测SARS-CoV-2病原体负重对化学物质生态的负面状况以及钙卫细胞层面与SDI彼此之间的正方面人关系（绘出1c，d；缺少绘出1b–d）。

我们运用挑选出当中分解成的所有数学模型，必要性近似值了所有固定效可不的加权普遍性评价（方知法则；缺少绘出1e）。这些评价确实，设为最佳数学模型的三个请注意达式（ICU时间段、SARS-CoV-2病原体负重和钙卫细胞层面）的相比之下普遍性最较高，其次是CRP层面和机械设计充填。青霉素头孢曲松、美罗培南或哌拉西林联合他唑巴坦外科手术的普遍性评价下限，美罗培南/哌拉西林联合他唑巴坦给药性前后赢得的抽样彼此之间未曾推测SDI的突出差别（缺少绘出1f）。

综上，我们的统计数据确实，呼吸种系统化学物质群集生态与ICU中风时间段、SARS-CoV-2病原体负重和钙卫细胞层面方面。该描述符当中，虽然我们未曾曾推测青霉素的换用兼具突出性状况，但我们只能忽略青霉素给药性或其他医学概念化都会引发SDI随时间段而增较高的或许。

3 呼吸化学物质群集的三大多是由巨大变化与呼吸背书和方面医学概念化方面

必要性，我们在旧属层面上说明了了上呼吸种系统化学物质群集三大多是由和研究者当中搜集的广泛宏统计数据彼此之间的潜在方面性。总的来说，我们一共校准了还包括与病患人体测量仪器、药性物以及在医院测量的医学请注意达式方面的同德请注意达式，以及SARS-CoV-2病原体负重、寄生物肝炎症请注意达和在拭子当中测量的致病肝细胞群集（缺少统计数据1）在内的72个同德请注意达式。在单请注意达式归纳当中，这些同德请注意达式当中有20个同德请注意达式与化学物质群集三大多是由彼此之间突出方面（dbRDA，p < 0.05；FDR < 0.05；绘出2a）。这些突出同德请注意达式与性疾病及其情况严重层面当前方面，如病患的医学评论者、ICU总中风时间段、抽样时ICU中风天数或病患所需的二磷化碳背书型式。尽管SARS-CoV-2病原体负重与整体而言生态彼此之间兼具方面性，但其与化学物质群集三大多是由请注意征彼此之间未曾曾展示造出造出突出的方面人关系（缺少统计数据1）。无论是现在正在换用何种型式的青霉素，还是正在换用多少种青霉素，大多为展示造出造出突出性人关系，但特定青霉素美罗培南/哌拉西林-他唑巴坦（既往换用过或正在完成的换用）以及头孢曲松（数正在完成的给药性）给药性与化学物质群集三大多是由彼此之间展示造出造出突出性方面（缺少统计数据1，绘出2a）。

绘出2 COVID-19的上呼吸种系统化学物质三组同德请注意达式。a亦然只能突出暗示该描述符（n = 101，dbRDA）上呼吸种系统化学物质群集请注意征的同德请注意达式（p

在多请注意达式归纳当中，这20个兼具突出性的同德请注意达式当中数病患ID和挖掘抽样时做的二磷化碳背书型式这2个同德请注意达式暗示了该统计数据集当中48.7%的非分块请注意征（dbRDA；p = 0.001），而其余请注意达式保留分块接收者。其当中病患ID被设为一般性是由于只能对病患完成纵向抽样抽样，并用做推测个肝细胞随时间段的巨大变化小于病患幼体间的巨大变化（绘出2a、b）。值得一提的是的是，基于相同充填方式为的二磷化碳背书型式可对相同抽样完成区隔，其当中无创充填抽样（第1、2和3三组）与放血病患抽样（第4-7三组）分离（PERMANOVA挑选出，R2 = 0.0642，p = 0.001）。基于这种分离，我们必要性评论者了既往机械设计充填（不考虑特定三组）是否是都会对化学物质群集三大多是由产生突出状况，通过归纳我们推测，既往机械设计充填展示造出造出比数考虑正在完成的机械设计充填导致愈来愈大的状况效果（PERMANOVA挑选出，R2 = 0.0965，p = 0.001），这确实这种侵入性操控或许导致以致于段的状况。

机械设计充填本质上与其他医学概念化方面，如给予广谱青霉素或完成去污程序（还包括氯己定清洗）以预防措施/外科手术呼吸机方面肝炎。因此，我们探讨了青霉素的换用是否是可以暗示化学物质群集三大多是由和磷背书型式彼此之间的突出人关系。我们推测，从与化学物质群集三大多是由方面的特定青霉素来看，头孢曲松主要用做做无创充填病患（卡方挑选出，p = 0.001），而美罗培南或哌拉西林-他唑巴坦则原则上用做做机械设计充填的病患（卡方挑选出，p = 0.002；缺少绘出2a）。这种方面性并不是偶然发生的，UZ Leuven的大学医院现行外科手术读物就曾指造出：病患入院时给予头孢曲松3-7天，可以预防措施潜在的海洋生物体合并受到感染。在我们的描述符当中，80%的病患在中风开始时做了头孢曲松外科手术（缺少绘出2b）。ICU中风时间段较长且只能很低层面二磷化碳背书的病患将被看做患有医院赢得性/呼吸机方面肝炎（HAP/VAP），并做美罗培南或哌拉西林/他唑巴坦联合外科手术（缺少绘出2b）。因此，性疾病的情况严重层面和ICU中风时间段可用做暗示本研究者所掩蔽到的磷背书型式与这些青霉素彼此之间的方面性。

因此，我们必要性说明了了数磷背书型式所导致的状况，我们换用以外dbRDA概括病患ID和两个突出的青霉素同德请注意达式，以提取数磷背书的效可不量。去基石数学模型推测造出与整体而言化学物质群集三大多是由彼此之间的突出性方面人关系（以外dbRDA；R2 = 0.058，p = 0.042），这一结果确实，尽管青霉素给药性可以暗示掩蔽到的化学物质群集三大多是由的以外请注意征，但这或许展示造出在独立于磷背书型式大多的状况。然而，伴随着机械设计充填完成的其他概念化（如换用氯己定清洗液完成舌腔去污）所导致的状况（这些操控与机械设计充填总是同时完成），因此只能独立于机械设计充填而完成检验。

必要性我们在种或细细菌的层面上完成检验，以在愈来愈精细的新物种层面上说明了磷背书或方面概念化对化学物质群集落所导致的状况。基于归纳，我们推测，即使是换用无创充填（由此可知如，BIPAP、CPAP），充填也都会相反抗生素或细细菌层面的生态。在充填之前，我们在所有抽样当中掩蔽很低的抗生素以及高于的细细菌生态，但无论是那种形式的充填（除了吸入磷酸化的充填大多），大多使得这种生态造出现相反的巨大变化，即充填在此之后展示造出造出高于的抗生素生态以及很低的细细菌生态（绘出2c；Wilcoxon挑选出；p < 0.05，7型除外）。此外，种和细细菌层面上的生态彼此之间展示造出造出很强的负方面人关系（绘出2d；Pearson方面性，R2 = -0.92，p = 0.0035）。

鉴于我们所掩蔽到的机械设计充填对化学物质群集落三大多是由整体而言的状况，我们评论者了放血和非放血病患抽样彼此之间兼具差别总质量的特定归入群集。一共28个海洋生物体旧属在机械设计充填病患抽样当中比较丰富，而1个海洋生物体旧属在无创充填病患当中比较丰富（p < 0.05；FDR < 0.05；绘出2e，缺少绘出3a；缺少统计数据2）。当调控青霉素头孢曲松和美罗培南/哌拉西林的状况时，两三组抽样彼此之间有20个细菌旧属发挥持久突出差别（缺少绘出3b，缺少统计数据2）。其当中一些归入群集是常方知的舌腔化学物质三组一细菌类细菌或条件致病细菌，在已有的诸多研究者当中，相较于相符合三组，这些化学物质类群集在COVID-19病患当中愈来愈丰富，这些化学物质类群集还包括德斯雷沃细菌旧属（Prevotella）、梭杆细菌旧属（Fusobacterium）、卟啉单胞细菌（Porphyromonas）或乳酸杆细菌旧属（Lactobacillus）。本研究者当中我们推测，与非机械设计充填的COVID-19病患相比，在机械设计充填的COVID-19病患当中，这些细菌旧属的总质量愈来愈较高。这确实机械设计充填（以及方面的概念化操控，如舌腔去污）是既往COVID-19研究者的潜在普遍存在状况。此外，我们推测了先前COVID-19化学物质三组研究者当中未曾份文件的但却与呼吸机方面肝炎风险方面的其他归入群集，如HIV细菌（Mycoplasma）或巨球形细菌旧属（Megasphaera）（绘出2e，缺少绘出2）。

通过提取完全相同于这些差别丰富旧属的扩增子数列变体（ASVs）（方知法则），其当中一些归入群集可以精细到种层面，推测其举例来说为典型的舌腔海洋生物体：由此可知如，德斯雷沃细菌旧属还包括P. oris、唾液德斯雷沃细菌（P. salivae）、栖牙德斯雷沃细菌（P. denticola）、口颊德斯氏细菌（P. buccalis）和舌腔德斯雷沃细菌（P. oralis）。在HIV细菌旧属当中，ASVs被归类为其他抗生素当中的唾液HIV细菌（Mycoplasma salivarium）---一种与呼吸机方面肝炎发生方面的舌腔海洋生物体。当调控充填型式时，未曾推测与SARS-CoV-2病原体负重方面的归入群集（缺少统计数据2）。这些结果确实，只能愈来愈大的描述符来必要性研究者并调控本研究者现在所强调的方面普遍存在状况，如充填型式、青霉素换用或ICU中风时间段等，以必要性说明了病原体受到感染的具肝细胞容状况。

4 淋巴肝泡液的单肝细胞RNA-seq可识别下呼吸种系统的舌腔一细菌类细菌和条件致病细菌

接下来，我们探讨了肝化学物质群集紊乱所引发的程序结果（性疾病或外科手术驱动）的或许。为此，我们挑选出了35由此可知病患淋巴肝泡湿洗（BAL）抽样导致的寄生物单肝细胞RNA-seq统计数据，以对化学物质reads完成深入研究者（方知法则）。该横断面描述符当中的所有病患大多展示造出造出肝炎的医学症状，其当中22由此可知被诊疗为COVID-19，其他13由此可知非COVID-19肝炎人群集被表述为相符合三组（请注意1）。在对35由此可知病患在抽样时，有21由此可知住进ICU（还包括20由此可知COVID-19病患和1由此可知相符合病患），其余14由此可知在疗养院中风（还包括2由此可知COVID-19病患和12由此可知相符合；请注意1和缺少绘出4）。我们从这些抽样当中平大多得到了7295.3个化学物质reads/抽样（之内从0到74,226个reads，只有一个抽样导致零个化学物质read；缺少绘出4）。

在这些病患当中主要优势归入群集当中，我们推测与舌咽拭子当中赢得的统计数据近似于。检造出的前15位抗生素还包括唾液HIV细菌---5由此可知住进ICU的COVID-19病患的主要归入群集，以及相同的德斯雷沃细菌成员。住进德斯通疗养院（即非机械设计充填）的非COVID-19肝炎病患载有相同的化学物质：2由此可知病患的化学物质三组以牙龈卟啉单胞细菌（Porphyromonas gingivalis）大多，而1由此可知病患的化学物质三组以真细菌耶氏肝孢子细菌（Pneumocystis jirovecii）大多---一种引发肝孢子细菌肝炎（Pneumocystis pneumonia，PCP）的据信病原体。

5 下呼吸种系统海洋生物体与COVID-19病患先天性致病种系统的寄生物肝细胞方面

随后，我们运用单肝细胞复本的优点（兼具查看自由人社会生活精神状态的独特复本），并提造出疑问---我们深入研究者的化学物质reads是否是与寄生物肝细胞方面（由此可知如受到感染或内化）。总体而言，我们一共深入研究者到29,886个唯一复本，并最简单到一共46,151个化学物质UMI。但这些复本的UMI栖息于并不兼具大多一性，其之内从1到201少于，与此同时，我们推测有88%的复本数兼具单个UMI。此外，有26,572个复本（89%）与一般而言化学物质抗生素方面，其余的复本与2个抗生素（8.8%）或愈来愈多抗生素（2.2%）方面。

在总一共29,886个化学物质复本当中，只有2,108个同时被分配到寄生物肝细胞当中，这确实在BAL抽样当中推测的大以外海洋生物体以自由人社会生活的有机体或海洋真核细胞的形式发挥持久。尽管只能通过孔径评论者来测试者这一假定，但在先前的研究者当中，在淋巴肝泡湿洗液当中曾就有到海洋生物体海洋真核细胞的发挥持久。然而，对于与寄生物肝细胞方面的海洋生物体以外，相同性疾病型式的栖息于并不兼具随机性。我们推测，虽然有2.3%的非COVID-19病患肝细胞与海洋生物体方面，但在COVID-19病患当中只能掩蔽到愈来愈多的与海洋生物体方面的肝细胞（近乎是两倍，左从右4%）（绘出3a；卡方挑选出；p = 3.75*10-35）。但是，由于在该描述符当中COVID-19诊疗与机械设计充填较高度方面，该效可不或许是由于COVID-19病患的放血赴援很低所引发，并且也或许是较高VAP发病赴援所引发。在COVID-19病患当中，我们还检验了海洋生物体方面寄生物肝细胞和探测到SARS-CoV-2 reads的肝细胞彼此之间的重叠（附请注意2）。在COVID-19病患当中探测到的与海洋生物体方面的1033个寄生物肝细胞和探测到SARS-CoV-2 reads的343个肝细胞当中，只有一个肝细胞的病原体和海洋生物体reads大多为HIV。在同一寄生物肝细胞当中病原体和海洋生物体探测发言权的二项式挑选出确实，掩蔽到数在一个肝细胞当中同时造出现的或许性很低（p = 5.7*10-4），这些结果确实，在同一寄生物致病肝细胞当中化学物质三大多是由员和病原体相互间排斥。然而，亦须要注意的是，本研究者当中的未曾探测并不一定意味着缺乏海洋生物体/病原体与寄生物肝细胞的关联，这在与单肝细胞RNAseq等测试法则方面联的研究者当中尤需值得一提的是，因为这些法则的设计用做归纳寄生物肝细胞，并无法针对这些实体的探测完成优化。因此，只能愈来愈大抽样量的必要性研究者来测试者一共忽略假定。

考虑到COVID-19病患和相符合三组病患当中肝细胞型式的频赴援相同，我们还探讨了寄生物方面海洋生物体reads是否是原则上与特定肝细胞型式方面联（方知法则）。这种原则上关联确实这些掩蔽结果兼具海洋生物学方面性，而不是单肝细胞容器和文库制备的假象。在相符合病患当中，两三组的肝细胞型式栖息于近似于，化学物质肝细胞数原则上与当惰性粒肝细胞结合（p = 3.61*10-12；绘出3b；缺少绘出4）。然而，在COVID-19病患当中，三种肝细胞型式与海洋生物体突出方面：当惰性粒肝细胞（p = 8.27*10-29）、单核肝细胞（p = 4.82*10-5）和单核肝细胞源性巨噬肝细胞（p = 2.23*10-51；绘出3b；缺少绘出5和缺少统计数据3）。此外，相同的海洋生物体与相同的寄生物肝细胞方面联。由此可知如，在COVID-19病患当中，HIV细菌旧属的海洋生物体原则上与单核肝细胞源性巨噬肝细胞方面（p = 2.28*10-7），而罗斯氏细菌旧属（Rothia）（p = 8.21*10-4）、肠杆细菌旧属（Enterobacter）（p = 2.59*10-5）或圣日尔曼细菌旧属（Klebsiella）（p = 3.12*10-9）在单核肝细胞当中钼（绘出3c，缺少统计数据3）。

绘出3 与下呼吸种系统化学物质群集方面的寄生物单肝细胞。a亦然在有性（n = 31923个肝细胞）和HIV（n = 33243个肝细胞）COVID-19病患当中，与海洋生物体方面（紫色色）以及与海洋生物体就其（浅蓝色）的肝细胞的相比之下比由此可知，其当中顶部的p值亦然基于蚱蜢卡方挑选出结果；b亦然海洋生物体方面肝细胞当中钼的肝细胞型式，柱状绘出亦然COVID-19HIV和有性病患当中与海洋生物体就其的（“否”；n = 63,463个肝细胞）以及与海洋生物体有关的（“是”；n = 1,703个肝细胞，其当中一共探测到2108个海洋生物体）肝细胞型式的比由此可知；c亦然原则上与特定肝细胞型式方面的海洋生物体旧属，其当中热绘出推测了相符合三组（左）和COVID-19HIV病患（从右）的蚱蜢卡方挑选出的标准化残差，这其当中还包括了所有海洋生物体旧属和海洋生物体当中钼的三种寄生物肝细胞型式，与任何肝细胞型式无突出方面性的Taxa未曾在绘出当中完成展示，此外，绘出当中紫色色亦然钼，浅蓝色亦然耗竭；d亦然与海洋生物体方面的寄生物肝细胞病原体性。热绘出推测了蚱蜢卡方挑选出的标准化残差，这其当中还包括兼具方面海洋生物体的当惰性粒肝细胞、单核肝细胞和单核肝细胞源性巨噬肝细胞病原体性，并将无海洋生物体的肝细胞作为时代背景，绘出当中紫色色亦然钼，浅蓝色亦然耗竭；e亦然探测到5种相同病原体性当惰性粒肝细胞的标记性状，这确实造出海洋生物体方面的肝细胞与非海洋生物体方面的肝细胞彼此之间的三组内差别；f亦然典型促炎性请注意达的脾脏系肝细胞程序性状集，两种病原体性骨脾脏肝细胞的抗炎和MHC编码性状与海洋生物体突出方面（CCL2hi-巨噬肝细胞和IL1Bhi-单核肝细胞），此外，热绘出还推测了海洋生物体方面肝细胞和非方面的肝细胞彼此之间的三组内差别。绘出当中*，**，***，****分别亦然p在0.05，0.01，0.001以及0.0001层面上兼具突出性差别，具肝细胞容精确的统计数据详方知缺少统计数据3。

最后，我们说明了了海洋生物体与寄生物肝细胞的关联是否是与寄生物肝细胞请注意达有关。为此，我们检验了当惰性粒肝细胞、单核肝细胞和巨噬肝细胞基于请注意达的肝细胞病原体性归入在该描述符的所有抽样当中是否是推测与海洋生物体的非随机方面性。在当惰性粒肝细胞当中，以钙粒细胞S100A12性状请注意达为特征的炎性当惰性粒肝细胞病原体性钼在海洋生物体方面肝细胞当中（卡方上部挑选出，p =7.18*10-6；绘出3d-e；缺少统计数据3）。此外，该亚群集肝细胞钼在SARS-CoV-2核糖蛋白性状reads当中，这确实负责防御病原体的相同肝细胞型式将对肝当中潜在的蹂躏性海洋生物体作造出响可不。该亚三组的特征是S100A8和S100A9编码的钙卫细胞亚基的请注意达。已有的研究者确实，S100A8/A9密切相关二聚体排泄在受到感染诱导的上皮细胞当中减低，并通过促炎性肝炎症的排泄、活性磷的释放和其他上皮细胞肝细胞的募集，以及海洋生物体酶活性所必需的Zn2+的螯合诱导兼具一定的功效持久。这些程序是通过S100A8/A9二聚体与TLR4受体结合进而诱发促炎性肝炎症的释放所诱导的，因此这或许有助于维系或加重上皮细胞反可不。因此，与海洋生物体的关联数可以以外暗示这种当惰性粒肝细胞亚群集的上皮细胞请注意型。为了必要性测试者这一假说，我们探讨了海洋生物体方面和非方面S100A12hi当惰性粒肝细胞彼此之间的差别性状请注意达（缺少统计数据4）。鉴于这些肝细胞与SARS-CoV-2彼此之间的连系和这些肝细胞与海洋生物体彼此之间的连系是相互间排斥的，我们也将这些巨大变化与病原体在当惰性粒肝细胞当中诱发的巨大变化完成了比较。在这个亚群集当中，一共存海洋生物体的当惰性粒肝细胞展示造出造出促炎性状的突出较高请注意达（p < 0.05），这还包括肝炎症IL1B及其一些靶性状（PTSG2）、FOS和JUN编码的磷酸化因子以及编码肝细胞脱粒方面细胞的几个性状（S100A9、FOLR3、HSPA1A，HSP90AA1，FCGR3B）（缺少统计数据4）。其当中，编码叶酸受体的性状FOLR3发挥持久于当惰性粒肝细胞排泄颗粒当中，通过结合叶酸盐，从而使海洋生物体丧失掉其必需的代谢产物，进而展示造出造出功效程序。由于IFN反可不性状不被海洋生物体明显上调，因此这种反可不与困住病原体的当惰性粒肝细胞相同。

就骨脾脏肝细胞而言，炎性IL1Bhi单核肝细胞（p < 2*10-16）以及请注意达CCL2的巨噬肝细胞混合三组（p = 5.38*10-10）大多钼在与海洋生物体方面肝细胞当中（绘出3f）。这些炎性单核肝细胞被认为在重度COVID-19病患发生的异常致病可不答当中发挥着重要的持久。在这种情况下，我们必要性探测了其性状的请注意达模式，对于CCL2hi巨噬肝细胞而言，与海洋生物体一共存的肝细胞请注意达愈来愈较高层面的I型和II型MHC性状，确实这些肝细胞在抗原呈圆形递当中展示造出造出愈来愈为积极的持久（p

综上，我们的结果确实，通过scRNA-seq归纳在这些肝细胞亚群集当中探测到的海洋生物体或许有助于在寄生物当中掩蔽到的上皮细胞反可不。

辩论

自COVID-19大流行开始以来，科学界在全球之内内完成了诸多努力，以了解SARS-CoV-2受到感染的生理反可不生理学和状况性疾病情节的风险状况。本研究者当中，我们说明了了呼吸种系统化学物质群集作为性疾病情况严重层面的潜在风险状况，并在整个中风在此之后检验了COVID-19病患的上呼吸种系统以及下呼吸种系统化学物质群集。我们将这些统计数据与nCounter和单肝细胞RNA性状组统计数据的病原体负重测量和致病归纳结果方面联。此外，为了检验既往份文件频谱的稳健性，我们基于广泛的病患宏统计数据请注意达式三组研究者了潜在普遍存在状况的状况。

我们推测在上呼吸种系统当中，SARS-CoV-2病原体负重与海洋生物体海洋生物生态呈圆形轻度负方面人关系。而情况严重层面当前（如钙卫细胞层面或ICU中风时间段）对海洋生物体海洋生物生态兼具愈来愈大的状况，随着住进ICU时间段的拉长，病患海洋生物体生态日渐增较高，这种模式与在其他肝部性疾病当中掩蔽到的模式近似于。外科手术并不只能或许诱导了ICU中风时间段的状况，如给予广谱青霉素外科手术或病患做放血或机械设计充填。由于青霉素的换用只能增较高整体而言化学物质的生态，还包括或许与上皮细胞方面的归入群集，这也恰恰暗示了为什么钙卫细胞层面与α生态方面。先前的就COVID-19病患化学物质群集生态的研究者推测造出一些相分歧结果：一些研究者确实COVID-19病患痰液或咽拭子抽样的生态高于，而其他换用淋巴肝泡液抽样关注下呼吸种系统化学物质群集的研究者则确实，COVID-19病患的海洋生物体生态很低相符合病患。本研究者当中我们掩蔽到的这些医学概念化对化学物质群集α生态的状况恰恰或许暗示了上述分歧导致的或许。尽管如此，我们仍只能忽略抽样部位或处理也或许是这些研究者当中的潜在普遍存在状况。

必要性研究者推测，相同情况严重层面当前（病患的医学精神状态，所接收的二磷化碳背书型式等）也都会状况病患彼此之间的化学物质群集请注意征（通过旧属层面化学物质β生态校准），其当中机械设计充填病患的化学物质群集有别于非放血病患。这种状况既只能用一般青霉素给药性也只能用特定青霉素的换用来完全暗示，这确实机械设计充填所导致的独立状况。在小描述符研究者当中也曾提造出过这种独立的效可不，但仍只能在愈来愈大规模的研究者当中完成测试者。然而，诸如放血操作过程当中伴随的去污程序等其他方面概念化，仍或许是现在掩蔽到的方面性的或许，由于COVID-19情况严重层面决定了只能完成的医学回避方式为，这使得我们只能完全忽略性疾病情况严重层面的普遍存在效可不。磷背书的状况也揭示在种和细细菌层面，放血分别引发生态的突出增较高和减低。综上所述，这些结果确实，无创充填（如BIPAP、CPAP）可以导致化学物质效可不确实任何形式的充填都或许是化学物质群集落差别的临界点。

既往COVID-19化学物质群集的研究者确实，在放血和非放血病患彼此之间巨大变化的几个归入群集与病患做的诊疗方面。在我们的研究者当中，在操控了机械设计充填后，未曾曾推测有与SARS-CoV-2病原体负重甲基化方面的归入群集。该结果确实，机械设计充填及其方面医学概念化发挥持久联想既往结果的或许性。事实上，一项对诊疗为的社区赢得肝炎的COVID-19病患的比较研究者推测，两三组病患的呼吸种系统化学物质群集三大多是由无差别，但两三组大多与生活品质相符合三组发挥持久差别。这些结果确实，在研究者上呼吸种系统化学物质群集时，病患放血甚至无创充填，以及其方面的医疗概念化被认为是重要的普遍存在状况，我们强烈建议未曾来的COVID-19化学物质群集研究者可不该预方知并对这个同德请注意达式完成必要的暗示。由此可知如，近期的一项研究者通过与之前在ICU病患当中完成的化学物质群集研究者完成比较，在操控了ICU方面的普遍存在状况后，推测了与罗斯氏细菌旧属旧属相完全相同的一般而言ASV，其对SARS-CoV-2病患兼具甲基化。此外，这些关于化学物质群集请注意征的潜在驱动状况的推测并非COVID-19性疾病所独有：放血对呼吸种系统化学物质群集的状况及其对呼吸机方面肝炎发病赴援的状况之前已有研究者。

为了愈来愈好地思考这些程序的潜在程序后果和方面的化学物质巨大变化，我们还换用从同一医院病患的横断面描述符当中赢得的单肝细胞统计数据对下呼吸种系统的化学物质群集完成了归纳。我们的结果确实，单肝细胞RNA-seq，尽管无法被优化用做化学物质探测和归纳，但可以对分开的海洋生物体或是与人类肝细胞方面的海洋生物体完成深入研究者。在本研究者描述符当中，我们考虑到了与寄生物肝细胞方面的海洋生物体亚群集（当惰性粒肝细胞、单核肝细胞和巨噬肝细胞）。虽然与当惰性粒肝细胞的方面性在COVID-19病患和相符合三组当中大多有推测，但与单核肝细胞和巨噬肝细胞的方面性是COVID-19病患所特有的。这种钼确实，这些海洋生物体或许不是随机污染物，由此可以预期跨肝细胞型式的大多匀栖息于（即考虑肝细胞型式总质量）。这些寄生物肝细胞的病原体性确实，海洋生物体或许被这些先天性致病种系统肝细胞困住，而不是附着在寄生物肝细胞请注意面。据我们所知，这是首次通过较高通量单肝细胞RNA-seq将相互间持久的寄生物肝细胞和肝化学物质群集连系起来的研究者。

我们推测与海洋生物体方面的寄生物肝细胞，其当中大多数都举例来说于舌腔，同时展示造出造出促炎请注意型以及用做抗原呈圆形递的较高层面MHC。在该单肝细胞描述符当中，掩蔽到MLT-COVID-19病患的特征为单核肝细胞向巨噬肝细胞的分化受到破坏，引发促炎性单核肝细胞的积累，以及当惰性粒肝细胞上皮细胞的拉长。鉴于只有这些肝细胞型式钼在海洋生物体当中，我们假定，呼吸种系统（或充填方面）化学物质群集或许在加剧下呼吸种系统COVID-19进展当中发挥持久。我们测试者了这种反可不或许是由海洋生物体驱动而非SARS-CoV-2。尽管我们在相同肝细胞当中无法探测到重叠的病原体和海洋生物体，但亦须要注意的是，这并只能完全忽略这些肝人肝细胞同时发挥持久病原体和海洋生物体。因此，只能必要性的研究者来推测化学物质群集在这种MLT-性疾病特征性的致病损伤当中的致病持久，并揭示其当中的具肝细胞容程序。

肝细菌群集当中舌腔归入群集的发挥持久并不是性疾病条件所特有的。值得一提的是，发生在生活品质人当中的透吸入或起源于舌腔的地球磁场气泡的吸入，可作为舌腔一细菌类细菌肝部定植的途径。当门诊病患（还包括但不限于COVID-19）完成放血时，可促进舌腔海洋生物体在下呼吸种系统的减低。事实上，舌腔海洋生物体与呼吸机方面肝炎有关。现在尚未曾说明了COVID-19生理反可不生理学是否是有利于舌腔海洋生物体的肝部定植，或是不利于其定植。据信的是，下呼吸种系统舌腔海洋生物体的减低可引发上皮细胞请注意型的减低，即使在生活品质受试者当中。

总体而言，本研究者对COVID-19化学物质群集研究者当中的潜在普遍存在状况完成了种系统归纳。我们推测，ICU中风和磷背书型式（或许数以外由医学概念化暗示，如青霉素换用）对上呼吸种系统化学物质三组有较大状况，并有或许联想医学化学物质群集的研究者。在相同型式的磷背书当中，我们份文件了放血和非放血病患彼此之间化学物质群集落结构的最大巨大变化。我们推测舌腔归入群集在机械设计充填COVID-19病患上呼吸种系统当中突出钼，在COVID-19病患下呼吸种系统当中也推测了特定的归入群集。此外，在下呼吸种系统当中，化学物质与甲基化促炎性致病肝细胞密切方面。这些接收者有助于汇聚关于COVID-19生理的史籍，并查看在检验肝化学物质群集对COVID-19性疾病的持久时，可不特别注意住进ICU时间段和二磷化碳背书的型式以及方面的医学概念化（如青霉素的换用或舌腔去污程序）。

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